<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<codeBook xmlns="ddi:codebook:2_5" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:xs="http://www.w3.org/2001/XMLSchema" xsi:schemaLocation="ddi:codebook:2_5         http://www.ddialliance.org/Specification/DDI-Codebook/2.5/XMLSchema/codebook.xsd">
  <docDscr>
    <citation>
      <titlStmt>
        <titl xml:lang="FR">Cohorte de patients en attente de greffe pulmonaire ou cardio-pulmonaire</titl>
        <subTitl/>
        <altTitl xml:lang="FR">COLT : Cohort in lung transplantation</altTitl>
        <altTitl xml:lang="EN">COLT : Cohort in lung transplantation</altTitl>
        <parTitl xml:lang="EN">Cohort in lung transplantation</parTitl>
        <IDNo>PEF60154</IDNo>
      </titlStmt>
      <rspStmt>
        <AuthEnty affiliation="ITMO Santé Publique, Aviesan">Portail Épidémiologie-France</AuthEnty>
        <othId/>
      </rspStmt>
      <prodStmt>
        <producer abbr="PEF-HD" affiliation="ITMO Santé Publique, Aviesan">Portail Épidémiologie-France | Health Databases</producer>
        <copyright>Portail Épidémiologie-France 2026</copyright>
        <prodDate date="2026-04-08">08/04/2026</prodDate>
        <prodPlac>https://epidemiologie-france.aviesan.fr/</prodPlac>
        <software/>
        <fundAg/>
        <grantNo/>
      </prodStmt>
      <distStmt>
        <distrbtr>Portail Épidémiologie-France</distrbtr>
        <contact email="portail-epidemiologie@inserm.fr">Portail Epidemiologie-France</contact>
        <depositr>Antoine Magnan</depositr>
        <depDate xml:lang="FR">08/03/2013</depDate>
        <depDate xml:lang="EN">11/06/2013</depDate>
        <distDate>08/11/2018</distDate>
      </distStmt>
      <serStmt>
        <serInfo/>
      </serStmt>
      <verStmt>
        <version xml:lang="FR" date="08/11/2018">3</version>
        <version xml:lang="EN" date="08/11/2018">3</version>
        <verResp>Antoine Magnan</verResp>
        <notes/>
      </verStmt>
      <biblCit/>
      <holdings xml:lang="FR" location="Portail Epidemiologie-France" URI="http://admin-epid-prod2.inserm.fr/en/layout/set/print/content/view/full/84662">COLT : Cohort in lung transplantation - Cohorte de patients en attente de greffe pulmonaire ou cardio-pulmonaire</holdings>
      <holdings xml:lang="EN" location="Portail Epidemiologie-France" URI="http://admin-epid-prod2.inserm.fr/en/layout/set/print/content/view/full/84663">COLT - Cohort in lung transplantation</holdings>
      <notes/>
    </citation>
    <guide/>
    <docStatus/>
    <notes/>
  </docDscr>
  <stdyDscr>
    <citation>
      <titlStmt>
        <titl xml:lang="FR">Cohorte de patients en attente de greffe pulmonaire ou cardio-pulmonaire</titl>
        <subTitl/>
        <altTitl xml:lang="FR">COLT : Cohort in lung transplantation</altTitl>
        <altTitl xml:lang="EN">COLT : Cohort in lung transplantation</altTitl>
        <parTitl xml:lang="EN">Cohort in lung transplantation</parTitl>
        <IDNo/>
      </titlStmt>
      <rspStmt>
        <AuthEnty affiliation="INSERM / CHU DE">Antoine Magnan</AuthEnty>
        <othId xml:lang="FR">Participation au projet Européen SysCLAD Participation au réseau Européen ENCE LTx CF LM</othId>
        <othId xml:lang="EN">Participation to the SysCLAD European Project Participation to the ENCE network</othId>
      </rspStmt>
      <prodStmt>
        <producer role="Public">CHU DE NANTES</producer>
        <copyright/>
        <prodDate/>
        <prodPlac>Institut du Thorax UMR 1087 - INSERM / CHU DE - 44000 NANTES</prodPlac>
        <software/>
        <fundAg xml:lang="FR" role="Mixte">PHRC NATIONAL 2009 ASSOCIATION VAINCRE LA MUCOVISCIDOSEAGENCE DE BIOMEDECINEINSERM RESEAUX</fundAg>
        <fundAg xml:lang="EN" role="Mixed">PHRC NATIONAL 2009 ASSOCIATION VAINCRE LA MUCOVISCIDOSEAGENCE DE BIOMEDECINEINSERM RESEAUX</fundAg>
        <grantNo/>
      </prodStmt>
      <distStmt>
        <distrbtr>INSERM / CHU DE</distrbtr>
        <contact affiliation="INSERM / CHU DE" email="antoine.magnan@univ-nantes.fr">Antoine Magnan</contact>
        <depositr>Antoine Magnan</depositr>
        <depDate xml:lang="FR">08/03/2013</depDate>
        <depDate xml:lang="EN">11/06/2013</depDate>
        <distDate xml:lang="FR">08/11/2018</distDate>
        <distDate xml:lang="EN">08/11/2018</distDate>
      </distStmt>
      <serStmt>
        <serName/>
        <serInfo/>
      </serStmt>
      <verStmt>
        <version xml:lang="FR" date="08/11/2018">3</version>
        <version xml:lang="EN" date="08/11/2018">3</version>
        <verResp>Antoine Magnan</verResp>
        <notes/>
      </verStmt>
      <biblCit/>
      <holdings/>
      <notes/>
    </citation>
    <studyAuthorization>
      <authorizingAgency>CNIL</authorizingAgency>
      <authorizationStatement xml:lang="FR">CNIL : 911142 ; CPP n°2009-R4 le 24/02/2009 ; Afsapps : B90121-60</authorizationStatement>
      <authorizationStatement xml:lang="EN">CNIL : 911142 ; CPP n°2009-R4 le 24/02/2009 ; Afsapps : B90121-60</authorizationStatement>
    </studyAuthorization>
    <stdyInfo>
      <studyBudget/>
      <subject>
        <keyword xml:lang="FR">transplantation pulmonaire</keyword>
        <keyword xml:lang="FR">dysfonction chronique du greffon</keyword>
        <keyword xml:lang="FR">biomarqueurs</keyword>
        <keyword xml:lang="EN">Lung Transplantation</keyword>
        <keyword xml:lang="EN">Chronique Lung Allograft dy</keyword>
        <topcClas xml:lang="FR">Pneumologie</topcClas>
        <topcClas xml:lang="EN">Pneumology</topcClas>
        <topcClas xml:lang="FR">Génétique</topcClas>
        <topcClas xml:lang="EN">Genetic</topcClas>
      </subject>
      <abstract xml:lang="FR">Objectif de la base de données : Objectif général : mettre en évidence des marqueurs prédictifs de la survenue du rejet chronique de greffe pulmonaire par des approches d'immunologie, de transcriptomique, de génomique, de protéome appliquées au prélèvements sanguins et in situ réalisés sur les patients de la cohorte.</abstract>
      <abstract xml:lang="EN">Database objective : Highlight preditive factors of the occurrence of chronic lung allograft dysfunction by immunologic, transcriptomics, genomics and proteomics approaches applied to blood and in situ samples performed on&#13;
patients.</abstract>
      <sumDscr>
        <timePrd/>
        <collDate event="start">09/2009</collDate>
        <collDate event="end"/>
        <collDate xml:lang="FR">Collecte des données active</collDate>
        <collDate xml:lang="EN">Current data collection</collDate>
        <nation>France</nation>
        <geogCover xml:lang="FR">Cohorte multicentrique impliquant les 11 centres de transplantation français et le centre d'Erasme à Bruxelles (Belgique).</geogCover>
        <geogCover xml:lang="EN">Multicentric cohort including the 11 French centers for transplantation and the Erasme center in Brussels (Belgium)</geogCover>
        <geogUnit>International</geogUnit>
        <anlyUnit xml:lang="fr">individuel
                </anlyUnit>
        <anlyUnit xml:lang="en">individuals
                </anlyUnit>
        <universe xml:lang="FR" clusion="I">Hommes et femmes âgés de plus de 18 ans, sur liste d'attente de greffe pulmonaire ou cardio-pulmonaire, ou inclus au moment de la transplantation, ayant donné leur consentement écrit.</universe>
        <universe xml:lang="EN" clusion="I">Men and women aged over 18 years who are on the waiting list for lung or cardiopulmonary transplantation or included the day of transplantation, and who give their written inform consent.</universe>
        <universe xml:lang="FR">Nombre d'individus : 1870 included patient, 1560 transplanted patients followed up</universe>
        <universe xml:lang="EN">Number of individuals: 1870 patients included pre-transplantation, from which 1560 transplanted patients</universe>
        <universe xml:lang="FR">Recrutement via une sélection de services ou établissements de santé</universe>
        <universe xml:lang="EN">Recruiting through a selection of health institutions and services</universe>
        <universe xml:lang="FR" level="Tranche d'âge">Adolescence (13 à 18 ans)</universe>
        <universe xml:lang="FR" level="Tranche d'âge">Adulte (19 à 24 ans)</universe>
        <universe xml:lang="FR" level="Tranche d'âge">Adulte (25 à 44 ans)</universe>
        <universe xml:lang="FR" level="Tranche d'âge">Adulte (45 à 64 ans)</universe>
        <universe xml:lang="FR" level="Tranche d'âge">Personnes âgées (65 à 79 ans)</universe>
        <universe xml:lang="EN" level="Age range">Adolescence (13 to 18 years)</universe>
        <universe xml:lang="EN" level="Age range">Adulthood (19 to 24 years)</universe>
        <universe xml:lang="EN" level="Age range">Adulthood (25 to 44 years)</universe>
        <universe xml:lang="EN" level="Age range">Adulthood (45 to 64 years)</universe>
        <universe xml:lang="EN" level="Age range">Elderly (65 to 79 years)</universe>
        <universe xml:lang="FR" level="Type de population">Sujets malades</universe>
        <universe xml:lang="EN" level="Population type">Sick population</universe>
        <universe xml:lang="FR" level="Pathologie"/>
        <universe xml:lang="EN" level="Pathology"/>
        <universe xml:lang="FR" level="Sexe">Masculin</universe>
        <universe xml:lang="FR" level="Sexe">Féminin</universe>
        <universe xml:lang="EN" level="Sex">Male</universe>
        <universe xml:lang="EN" level="Sex">Female</universe>
        <dataKind xml:lang="FR">Bases de données issues d’enquêtes</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">Study databases</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR">Etudes de cohortes</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">Cohort study</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR">Données cliniques : Examen clinique au cours du suivi pré-transplantation et post-transplantation tous les ans Informations recueillies : antécédents, traitements concomitants, colonisation bactérienne et virale, épisodes de rejets, infections, fonction respiratoire, complication de la transplantation, immunologie, survie</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR">Données biologiques : Pour les 1200 premiers patients transplantés suivis: à chaque visite, une prise de sang veineux pour l’analyse des populations lymphocytaires, du génome et du transcriptome seront systématiquement réalisées. Selon les possibilités et les pratiques de chaque centre, une expectoration induite (EI) ainsi qu’un prélèvement de condensat de l’air exhalé (CAE) seront réalisés. Un prélèvement de liquide broncho-alvéolaire (LBA), et/ou 2 biopsies trans-bronchiques seront obtenus selon les habitudes de chaque centre</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">Clinical data: Clinical examination before trnasplantation and post-transplantaiton every 6 months. Data collected : medical history, concomitant medications, bacterial and viral colonization,  episodes of rejection, infections, respiratory function, transplantation complication, immunology, survival</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">Biological data: For the 1200 first transplanted patients: at each visit, blood sample for immunological, genomic, and transcriptomic analysis will be collected. According to practices of each centers, induced sputum, Exhaled Air Condensate will also be collected. Broncho Alveolar fuids and transbronchial biopsies will be collected according to the habits of each center.</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR">Sang total</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR">Sérum</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR">Plasma</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR">Cellules sanguines isolées</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR">Autres fluides (salive, urine, liquide amniotique, …)</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR">ADN</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR">ADNc/ARNm</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR">Autres</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">Whole blood</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">Serum</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">Plasma</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">Blood cells isolated</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">Fluids (saliva, urine, amniotic fluid, …)</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">DNA</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">DNAc/RNAm</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">Others</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR">Biothèque : Plasmathèque, Sérothèque, PBMC, ADN, ARN (pour tous les patients à chaque visite), biopsies transbronchiques, surnageant d'expectoration induite, de condensat d'air exhalé, de liquide broncho-alvéolaire (si examens demandés dans la prise en charge du patient)</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">Biobank: Plasma Bank, Serum Bank, PBMC DNA, RNA, transbronchial biopsy, supernatant of induced sputum, exhaled air condensate, broncho-alveolar liquid</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR">Evénements de santé/morbidité</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR">Evénements de santé/mortalité</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">Health event/morbidity</dataKind>
        <dataKind xml:lang="EN">Health event/mortality</dataKind>
        <dataKind xml:lang="FR"/>
        <dataKind xml:lang="EN"/>
      </sumDscr>
      <qualityStatement>
        <standardsCompliance>
          <standard>
            <standardName/>
            <producer/>
          </standard>
          <complianceDescription/>
        </standardsCompliance>
        <otherQualityStatement xml:lang="FR">Procédures qualité utilisées : Présence d'une requête de cohérence : Au moment de la saisie des données informatiques et après la saisie des données informatiques Gestion des données manquantes : Retour au dossier source Relance des médecins pour réaliser les visites de suivi ? Oui Relance des sujets pour réaliser les visites de suivi ? Oui Réalisation d'audit qualité : Audits internes Fréquence audit interne : 1 FOIS PAR AN Autre(s) procédure(s) qualité : Procédures qualité CIC (Centre d'Investigation Cliniques) Thorax de Nantes Procédures qualité CRB (Centre de Ressources Biologiques) Les patients sont informés de l'utilisation de leur données (Ecrite)</otherQualityStatement>
        <otherQualityStatement xml:lang="EN"/>
        <otherQualityStatement xml:lang="FR"/>
        <otherQualityStatement xml:lang="EN"/>
        <otherQualityStatement xml:lang="FR">Existence d'un comité scientifique ou de pilotage</otherQualityStatement>
        <otherQualityStatement xml:lang="EN">Existence of a sterring or scientific comittee</otherQualityStatement>
      </qualityStatement>
      <notes/>
      <exPostEvaluation>
        <evaluator/>
        <evaluationProcess/>
        <outcomes/>
      </exPostEvaluation>
    </stdyInfo>
    <studyDevelopment>
      <developmentActivity>
        <description/>
        <participant/>
        <resource>
          <dataSrc/>
          <dataSrc/>
          <dataSrc/>
          <dataSrc/>
          <srcOrig/>
          <srcChar/>
          <srcDocu/>
        </resource>
        <outcome/>
      </developmentActivity>
    </studyDevelopment>
    <method>
      <dataColl>
        <timeMeth method="http://www.ddialliance.org/Specification/DDI-CV/TimeMethod_1.2_Genericode1.0_DDI-CVProfile1.0.xml">Longitudinal: Cohort/Event-based</timeMeth>
        <dataCollector affiliation="INSERM / CHU DE">Antoine Magnan</dataCollector>
        <collectorTraining/>
        <frequenc xml:lang="FR">Durée du suivi : 10 ans</frequenc>
        <frequenc xml:lang="EN">10 years follow-up</frequenc>
        <sampProc xml:lang="FR">Cohorte Prospective</sampProc>
        <sampProc xml:lang="EN">Prospective cohort</sampProc>
        <deviat/>
        <collMode xml:lang="FR">Saisie manuelle des informations recueillies durant l'entretient à partir de questionnaires papiers, avec double saisie Examens cliniques : saisie directe Examens biologiques : saisie directe</collMode>
        <collMode xml:lang="EN">Manual entry of information collected during medical examination from paper questionnaires, clinical examinations with double input: Direct input Laboratory tests: direct entry</collMode>
        <collMode xml:lang="FR">Dossier cliniqueExamen médical : Examen clinique au cours du suivi pré-transplantation et post-transplantation tous les ans Informations recueillies : antécédents, traitements concomitants, colonisation bactérienne et virale, épisodes de rejets, infections, fonction respiratoire, complication de la transplantation, immunologie, survie</collMode>
        <collMode xml:lang="EN">Direct physical measuresMedical registration: Clinical examination before trnasplantation and post-transplantaiton every 6 months. Data collected : medical history, concomitant medications, bacterial and viral colonization,  episodes of rejection, infections, respiratory function, transplantation complication, immunology, survival</collMode>
        <collMode xml:lang="FR">Pour les 1200 premiers patients transplantés suivis: à chaque visite, une prise de sang veineux pour l’analyse des populations lymphocytaires, du génome et du transcriptome seront systématiquement réalisées. Selon les possibilités et les pratiques de chaque centre, une expectoration induite (EI) ainsi qu’un prélèvement de condensat de l’air exhalé (CAE) seront réalisés. Un prélèvement de liquide broncho-alvéolaire (LBA), et/ou 2 biopsies trans-bronchiques seront obtenus selon les habitudes de chaque centre</collMode>
        <collMode xml:lang="EN">For the 1200 first transplanted patients: at each visit, blood sample for immunological, genomic, and transcriptomic analysis will be collected. According to practices of each centers, induced sputum, Exhaled Air Condensate will also be collected. Broncho Alveolar fuids and transbronchial biopsies will be collected according to the habits of each center.</collMode>
        <collMode xml:lang="FR"/>
        <collMode xml:lang="EN"/>
        <resInstru/>
        <instrumentDevelopment/>
        <sources>
          <dataSrc/>
          <srcOrig/>
          <srcChar/>
          <srcDocu/>
        </sources>
        <collSitu/>
        <actMin/>
        <ConOps/>
        <weight/>
        <cleanOps/>
      </dataColl>
      <notes/>
      <anlyInfo>
        <respRate/>
        <EstSmpErr/>
        <dataAppr/>
      </anlyInfo>
      <stdyClas/>
      <dataProcessing/>
      <codingInstructions>
        <txt/>
        <command/>
      </codingInstructions>
    </method>
    <dataAccs>
      <setAvail>
        <accsPlac/>
        <origArch/>
        <avlStatus xml:lang="FR">Utilisation possible des données par des équipes académiques via approbation du conseil scientifique de la cohorte. Utilisation possible des données par des industriels via approbation du comité directeur de la cohorte</avlStatus>
        <avlStatus xml:lang="EN">Possible data use by academic teams via approval of the Scientific Council of the cohort. Data can be used by industry via approval of the Director commitee of the cohort.</avlStatus>
        <collSize/>
        <complete/>
        <fileQnty/>
        <notes/>
      </setAvail>
      <useStmt>
        <confDec/>
        <specPerm/>
        <restrctn xml:lang="FR">Utilisation possible des données par des équipes académiques via approbation du conseil scientifique de la cohorte. Utilisation possible des données par des industriels via approbation du comité directeur de la cohorte</restrctn>
        <restrctn xml:lang="EN">Possible data use by academic teams via approval of the Scientific Council of the cohort. Data can be used by industry via approval of the Director commitee of the cohort.</restrctn>
        <contact/>
        <citReq/>
        <deposReq/>
        <conditions xml:lang="FR">Utilisation possible des données par des équipes académiques via approbation du conseil scientifique de la cohorte. Utilisation possible des données par des industriels via approbation du comité directeur de la cohorte</conditions>
        <conditions xml:lang="EN">Possible data use by academic teams via approval of the Scientific Council of the cohort. Data can be used by industry via approval of the Director commitee of the cohort.</conditions>
        <disclaimer/>
      </useStmt>
      <notes/>
    </dataAccs>
    <othrStdyMat>
      <relMat xml:lang="FR"/>
      <relMat xml:lang="FR"/>
      <relStdy/>
      <relPubl xml:lang="FR">http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=COLT+AND+Magnan+A[author]</relPubl>
      <relPubl xml:lang="EN">http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=COLT+AND+Magnan+A[author]</relPubl>
      <othRefs xml:lang="FR">2 brevets </othRefs>
      <othRefs xml:lang="EN">2 patents</othRefs>
    </othrStdyMat>
    <notes/>
  </stdyDscr>
</codeBook>
