84031114/03/201413/05/2015ValidatedValidated22/07/201413/05/2015Anne Doussinhttp://admin-epid-prod2.inserm.fr/en/layout/set/print/content/view/full/83314http://admin-epid-prod2.inserm.fr/en/layout/set/print/content/view/full/88097http://admin-epid-prod2.inserm.fr/en/layout/set/print/ccontent/xml/(NodeId)/83314Renforcement de la surveillance de maladies infectieuses en France à partir d'extraction automatisée de données biologiques issues de 3 laboratoiresTo Improve Infectious Disease Surveillance in France by Automated Biological Data Extraction from 3 Laboratories3LABOS3LABOS1415428 v01415428 v0Maladies infectieusesBiologieBiologyInfectious diseasesMaladies infectieusesdonnées tests laboratoiressurveillanceextraction automatiséeinfectious diseaseslaboratory test dataautomated extractionsurveillanceDuboisDaniel12 Rue du Val d’Osne, 94415 Saint-MauriceDMI@invs.sante.frInstitut de veilleDuboisDaniel12 Rue du Val d’Osne, 94415 Saint-MauriceDMI@invs.sante.frInstitut de veillePubliquePublicInstitut national de veille sanitaire (InVS)French Institute for Public Health Surveillance (InVS)InVSPublicInVSPublicBases de données issues d’enquêtesStudy databasesEtudes longitudinales (hors cohortes)Longitudinal study (except cohorts)Via une sélection de services ou établissements de santéA selection of health institutions and servicesNonNoPatients répondant aux critères d'inclusionPatients fulfilling the exclusion criteria.Surveillance de maladies infectieuses par un transfert régulier et automatisé de résultats biologiques de laboratoires de biologie spécialisée vers l’InVS. Améliorer la surveillance de certaines maladies infectieuses déjà surveillées par un autre système : o Compléter les données de surveillance en provenance d’autres sources, et estimer l’exhaustivité (MDO notamment) • Mettre en place une surveillance pérenne pour des maladies non surveillées par ailleurs : o Suivre les tendances spatio-temporelles des agents pathogènes ciblés o Disposer de données individuelles o Contribuer à l’investigation des épidémies o Repérer zones de circulation activeSurveillance of infectious diseases through regular automated transfer of biological results from specialist biology laboratories to InVS. To improve the surveillance of certain infectious diseases already monitored by another system: o To supplement surveillance data from other sources and to estimate completeness (particularly MDO). • To implement a sustainable monitoring system for unmonitored diseases as well as: o Monitoring spatial and temporal trends of targeted pathogens; o Providing individual data; o Contributing to epidemic investigations; o Identifying active movement areas.Personnes ayant fait l’objet d’un prélèvement biologique pour une des pathologies suivantes : rougeole, chikungunya, dengue, tuberculose, syphilis, fièvre Q, encéphalite à tique, leptospirose, borréliose de Lyme, psittacose, toxoplasmose congénitale, (dossier Cnil en cours pour : hépatite E, hépatite A, rubéole, saturnisme, gonocoque, chlamydia)Individuals who have had biological samples taken for the following diseases: measles, chikungunya, dengue fever, tuberculosis, syphilis, Q fever, tick-borne encephalitis, leptospirosis, Lyme disease, psittacosis, toxoplasmosis. (CNIL file in progress for: hepatitis E, hepatitis A, rubella, lead poisoning, gonorrhoea and chlamydia).Nouveau-nés (naissance à 28j)Nourrissons (28j à 2 ans)Petite enfance (2 à 5 ans)Enfance (6 à 13 ans)Adolescence (13 à 18 ans)Adulte (19 à 24 ans)Adulte (25 à 44 ans)Adulte (45 à 64 ans)Personnes âgées (65 à 79 ans)Grand âge (80 ans et plus)Newborns (birth to 28 days)Infant (28 days to 2 years)Early childhood (2 to 5 years)Childhood (6 to 13 years)Adolescence (13 to 18 years)Adulthood (19 to 24 years)Adulthood (25 to 44 years)Adulthood (45 to 64 years)Elderly (65 to 79 years)Great age (80 years and more)Population généraleGeneral populationMasculinFémininMaleWomanNationalNationalFranceFrance20122012> ou égal à 20 000 individusGreater than 20 000 individuals------Collecte des données activeCurrent data collectionDonnées biologiquesDonnées administrativesBiological dataAdministrative dataNom du labo, maladie, Résultats de tests laboratoires : sérologies, PCR etc. selon les maladies.Lab name, disease, laboratory test results: serology tests, CRP, etc. according to disease.Données patient : Code anonymat, date de naissance, sexe, code postal, identifiant de prélèvement Laboratoire : Raison sociale, adresse, code postal, commune, téléphone Prescripteur : Nom, prénom, adresse, code postal, commune, téléphonePatient data: anonymity code, date of birth, sex, post code, sample identifier. Laboratory: company name, address, post code, municipality, phone. Prescriber: surname, first name, address, post code, municipality, phone.NonNoConsommation de soins/services de santéAutresHealth care consumption and servicesOthersConsultations (médicales/paramédicales)Medical/paramedical consultationRésultats de tests biologiquesBiological test results.Extraction automatisée de données depuis 3 laboratoires vers l’InVS. Réception de fichiers par laboratoires et pathologie à fréquence déterminée (quotidienne ou mensuelle).Automated data extraction from 3 laboratories to InVS. Receipt of files per laboratory and disease at determined intervals (daily or monthly).Contrôles de cohérence lors de la transmission de données, programmes statistiquesConsistency controls during data transmission, statistical programmes.OuiYesSelon la pathologie surveillée, une surveillance renforcée et des investigations peuvent avoir lieu autour de cas positifs en relation avec les cellules de l’InVS en région (Cires).Improved surveillance and investigations may be implemented for positive cases in relation to regional InVS units (CIREs), according to the monitored disease.OuiYesLe code anonymat des individus de la base 3Labos est le même code utilisé pour la déclaration obligatoire.The individual anonymity code from the 3Labos database is the same code used for obligatory notification.http://admin-epid-prod2.inserm.fr/en/layout/set/printContacter le responsable scientifique / formulaire de demande de données à l’InVSContact the scientist in charge/Send data request form to InVS.